Sinopse: Murahagane conta a história de Momoyama Reiji que, juntamente com Shibasaki, trabalham para uma companhia chamada Murahagane, cuja finalidade é investigar crimes cometidos por Kaijins (um espécie de humano modificado por meio da tecnologia). Juntos com a Chefe e o Yanagida-kun, eles investigam os crimes mais estranhos.