Sinopse: A Academia Hanzo não é apenas uma escola regular. Ele contém uma classe secreta para treinamento ninja reservado apenas para a elite. Apenas duas meninas entraram este ano, Ikaruga, uma morena tranquila, mas talentosa, e Katsuragi, uma loira apaixonada. Suas personalidades não podia ser mais opostas e faíscas voam já no primeiro dia de aula. Ikaruga, sendo um pouco à frente, ultrapassa Katsuragi em cada atribuição. Com a tensão em alta, como é que estas duas estudantes ninja vão trabalhar juntos quando chegar a hora?